Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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