Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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