Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms