Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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