Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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