Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms