Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms