Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms