Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms