Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms