Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CD164Q04900 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CD164Q04900 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms