Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms