Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC00941-201ENST00000547804 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZNF684-202ENST00000372697 1028 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms