Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms