Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms