Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms