Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX1P78337 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX1P78337 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX1P78337 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX1P78337 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX1P78337 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX1P78337 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX1P78337 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms