Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS4XP62701 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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