Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARF6P62330 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARF6P62330 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARF6P62330 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARF6P62330 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARF6P62330 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARF6P62330 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARF6P62330 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARF6P62330 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARF6P62330 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARF6P62330 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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