Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF3P61204 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms