Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB10P61026 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB10P61026 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms