Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSX2P58304 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms