Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NME5P56597 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NME5P56597 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NME5P56597 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NME5P56597 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NME5P56597 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NME5P56597 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NME5P56597 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms