Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL23P55773 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL23P55773 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms