Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD4P55036 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD4P55036 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD4P55036 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms