Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms