Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms