Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms