Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCLMP48507 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms