Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID4P47928 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID4P47928 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ID4P47928 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms