Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms