Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms