Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSG1P42857 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NSG1P42857 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms