Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms