Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms