Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP6P35125 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP6P35125 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP6P35125 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP6P35125 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP6P35125 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms