Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms