Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDI1P31150 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDI1P31150 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms