Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms