Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms