Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PRKCHP24723 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PRKCHP24723 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PRKCHP24723 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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