Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGS1P23219 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms