Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MATN1P21941 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MATN1P21941 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms