Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT1P21579 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT1P21579 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT1P21579 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms