Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD247P20963 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms