Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms