Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms