Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPIP17213 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPIP17213 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPIP17213 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms