Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms