Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TOP2AP11388 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TOP2AP11388 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP2AP11388 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP2AP11388 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP2AP11388 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms